Amb la finalitat de donar suport als investigadors espanyols de qualsevol entitat, s'ha organitzat un sistema d'agents d'Horitzó 2020, que inclou Representants, Experts i Punts Nacionals de Contacte.
La xarxa dels Punts Nacionals de Contacte (NCPs) és la principal estructura que proporciona orientació, informació pràctica i assistència en tots els aspectes de participació d'H2020.
Espanya compta amb Punts Nacionals de Contacte tant horitzontals (coordinadors i NCPs d'assumptes legals i financers) com temàtics.
Així, d'una banda es troba Centre per al Desenvolupament Tecnològic Industrial (CDTI), que compta amb un equip de 29 persones amb dedicació exclusiva al Programa Marc de R+D+I de la UE (PM). Aquesta divisió està formada pels Departaments de Reptes Socials i Lideratge Industrial, del que també depèn l'oficina SOST a Brussel·les, i que respon a l'estructura dels pilars d'Horitzó 2020, en els quals el CDTI té competències de representació, gestió i estímul de la participació espanyola.
D'altra banda està l'Oficina Europea de la Fundació Espanyola per a la Ciència i la Tecnologia (FECYT) que compta amb els Punts de Contacte de l'ERC i Marie Curie, i amb personal tècnic especialitzat en investigació i innovació en el context europeu.
Entre les seues competències es troba:
Oferir orientació, assessorament i informació a tots els interessats a participar en projectes d'investigació i innovació europeus.
Difusió de les oportunitats de finançament
Formació específica sobre preparació de propostes i gestió de projectes
Proporcionar informació bàsica sobre altres programes europeus com Eureka o COSME.