La Unitat s’estructura en dues unitats tramitadores, INVES1 i INVES2, que gestionen tots els projectes assignats al centre de despesa INVES, el pressupost i projectes dels INSTITUTS, i els serveis de recolzament a la investigació SEA i SCIC. En concret, l’àmbit de cadascuna d’aquestes unitats tramitadores és:

INVES1: Projectes d’investigació i transferència de personal investigador adscrit a departaments de l’Escola Superior de Tecnologia i Ciències Experimentals, i els instituts IUPA, INAM, IUTC, INIT, IMAC.

INVES2: Projectes d’investigació i transferència de personal investigador adscrit a departaments de la Facultat de Ciències Jurídiques i Econòmiques, de la Facultat de Ciències Humanes i Socials i de la Facultat de Ciències de la Salut; així com els instituts IUDT, IDL, IEI, IDSP, IIG, IUEFG, IULMA, IIFV, IILP, IUTUR, IUCE.