El CBPID comença amb una breu carta de presentació i una introducció  tots dos apartats permeten comprendre la motivació de la creació del document i el context en el qual sorgeix. A continuació, el codi està dividit en set apartats. Els quatre primers estan dedicats als temes clau i transversals de les recerques: la integritat i bones pràctiques, la perspectiva de gènere, l'accés obert i la comunicació i compromís públic. Cadascú inclou exemples de males pràctiques i un petit glossari explicatiu dels termes i idees més rellevants de l'apartat. 

Els dos apartats següents es dediquen a l'aplicació del CBPID, tant  el que té a veure amb l'aplicació micro en els projectes de recerca, com el vinculat amb les estructures de governança necessàries per a la seva implantació. L'apartat final està dirigit al procés d'elaboració del codi.