El màster universitari en Química Teòrica i Modelització Computacional té una estructura global que va ser aprovada per la Comissió de la Universitat Autònoma de Madrid i per les altres Universitats del Consorci.
En resum es pot dir que: el màster consta íntegrament de 120 crèdits ECTS, distribuïts en dos cursos anomenats M1 i M2 (60+60). Està estructurat en sis mòduls (mòdul 1. Fonaments; mòdul 2. Mètodes; mòdul 3. Optativitat; mòdul 4. Aspectes Avançats; mòdul 5. Treball de Final de Màster dins d'un perfil investigador.
Primer any (M1)
Obligatòries (35 crèdits ECTS)
Mòdul 1. Fonaments (15 crèdits ECTS)
Competència Científica i Lingüística Transversal (OB) (5 crèdits ECTS)
Fonaments Matemàtics de la Mecànica Quàntica (OB) (5 crèdits ECTS)
Mecànica Estadística i Aplicacions en Simulació (OB) (5 crèdits ECTS)
Simetria en Àtoms, Molècules i Sòlids (OB) (5 crèdits ECTS)
Mòdul 2. Mètodes (20 crèdits ECTS)
Tècniques Computacionals i Càlcul Numèric (OB) (5 crèdits ECTS)
Mètodes de la Química Teòrica I (OB) (5 crèdits ECTS)
Mètodes de la Química Teòrica II (OB) (5 crèdits ECTS)
Mòdul 3. Optativitat (25 crèdits ECTS)
Sòlids (OP) (5 crèdits ECTS)
Linux i Linux de Gestió (OP) (5 crèdits ECTS)
Laboratori de Química Teòrica Aplicada (OP) (5 crèdits ECTS)
Làsers (OP) (5 crèdits ECTS)
Bioquímica Computacional (OP) (5 crèdits ECTS)
Aprofundiment en els Mètodes de la Química Teòrica (OP) (5 crèdits ECTS)
Estats Excitats (OP) (5 crèdits ECTS)
Dinàmica de les Reaccions Químiques (OP) (5 crèdits ECTS)
Segon any (M2)
Mòdul 3. Optativitat (18 crèdits ECTS)
Tècniques Computacionals Avançades (OP) (6 crèdits ECTS)
Multiescala, Machine Learning i Mètodes QSAR Aplicats a Biomolècules (OP) (6 crèdits ECTS)
Mètodes Teòrics per a la Simulació de Materials (OP) (6 crèdits ECTS)
Projecte de Programació de Química Computacional (OP) (6 crèdits ECTS)
De la Teoria a la Implementació: Tutorials en Química Teòrica (OP) (6 crèdits ECTS)
Modelització d'Estructura Electrònica (OP) (6 Crèdits ECTS)
Modelització Multiescala de Sistemes Moleculars Complexos (OP) (6 crèdits ECTS)
Química de Superfícies i Interfases: Experimentació i Modelització (OP) (6 Crèdits ECTS)
Mòdul 4. Aspectes avançats i Modelització (12 crèdits ECTS)
Mètodes Avançats en Estructura Electrònica, Dinàmica i Modelització Molecular (OB) (12 crèdits ECTS)
Mòdul 5. Treball de Final de Màster (30 crèdits ECTS)
Treball de Final de Màster (TFM) (30 crèdits ECTS)