El seu objectiu de contribuir a la innovació tecnològica, humanística i social del seu entorn i potenciar la vinculació entre l'àmbit acadèmic i el sistema productiu.

L'UJI compta amb 13 institus universitaris dedicats a la investigació científica i tècnica, la creació artística, el desenvolupament tecnològic i la innovació.

Vint-i-set departaments s'encarreguen de coordinar la docència universitària i donar suport a les activitats i iniciatives docents i investigadores.